Das erste Spiel der Vereinsgeschichte findet auf dem städtischen Spielplatz an der Schyrenstraße statt. Der FCB schlägt den 1. Münchner FC mit 5:2. Von 1900 bis 1907 spielt der Verein in Schwabing an der Clemensstraße 50 und wechselt danach zur Leopoldstraße. Von 1925 an spielt der FCB 47 Jahre lang im Grünwalder Stadion – bis zum Ende des Zweiten Weltkriegs als Untermieter von 1860 München.
Das erste Spiel im neuen Olympiastadion von München findet am letzten Spieltag der Saison 1971/72 statt. Von 1995 an muss der FC Bayern das Stadion mit 1860 München teilen. Das Trainingsgelände des FC Bayern befindet sich in München-Giesing an der Säbener Straße.